新突破！基于宏基因組學(xué)的ARDS的研究

近期，國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Frontiers in Molecular Biosciences》（影響因子6.113，3區(qū)）發(fā)表《Pulmonary Microbial Composition inSepsis-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome（膿毒癥導(dǎo)致的急性呼吸窘迫綜合癥中肺部微生態(tài)的組成）》文章。江門市中心醫(yī)院黃炎明、張爽和張?chǎng)问潜疚牡墓餐ㄓ嵶髡?，張鵬、劉寶儀和鄭偉浩是本文的共同第一作者。凱普作為參與單位一同完成該研究。

急性呼吸窘迫綜合征(Acute respiratory distress syndrome, ARDS)是一種發(fā)生在嚴(yán)重感染、休克、創(chuàng)傷和燒傷期間的臨床綜合征，主要由膿毒癥引起。其特征是低氧血癥和呼吸窘迫。由于ARDS進(jìn)展迅速，死亡率高，缺乏有效的治療，是急性和危重疾病患者死亡的主要原因之一。近年來(lái)，探索ARDS及時(shí)有效的治療方法和預(yù)后標(biāo)志物是研究熱點(diǎn)。當(dāng)前有研究表明肺部微生物組的改變與ARDS之間存在相互作用，微生物組的調(diào)節(jié)可能是ARDS的潛在治療或預(yù)防靶點(diǎn)。本研究使用宏基因組下一代測(cè)序（mNGS）對(duì)收集的支氣管肺泡灌洗液中的DNA進(jìn)行測(cè)序，以分析不同感染部位和預(yù)后的患者、以及抗生素治療前后肺部微生物組的變化。

研究對(duì)2018年1月至2021年6月江門市中心醫(yī)院重癥醫(yī)學(xué)科收治的膿毒癥致ARDS患者進(jìn)行了回顧性分析。將ARDS患者根據(jù)初始感染部位分為肺內(nèi)感染(ARDSp, n=111，57例為ARDSp-survival，54例為ARDSp-dead)和肺外感染(ARDSexp, n=45，20例為ARDSexp-survival，25例為ARDSexp-dead)兩組，選取輕度肺部感染患者作為對(duì)照組(n=28)。利用MetaPhlAn數(shù)據(jù)庫(kù)將2728個(gè)微生物分為病原微生物和本底微生物分別進(jìn)行分析，分別統(tǒng)計(jì)每組測(cè)序陽(yáng)性和陰性結(jié)果的數(shù)量。

PCA分析與Shannon-Wiener指數(shù)顯示，ARDSexp組的條件致病菌和腸道微生物的陽(yáng)性率和豐度均增加。而與ARDSexp組和對(duì)照組相比，ARDSp組的肺部微生物多樣性有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的降低，主要表現(xiàn)為病原微生物豐度增加，正常微生物多樣性減少。同時(shí)，根據(jù)ARDSp-survival和ARDSp-dead的PCA分析與微生物聚類分析結(jié)果表明：E.coli、S.aure、C.albi等腸道微生物或條件致病菌的增加可能是ARDSp死亡的潛在因素，而Hydrobacter可能是ARDSp存活的保護(hù)因素。同時(shí)，Cox多因素分析結(jié)果顯示本底微生物組中的Bilophila（注: 嗜膽菌）的增加可能是ARDSexp死亡的潛在因素。

綜上所述，不同的初始感染部位和預(yù)后可能會(huì)影響膿毒性ARDS患者肺部微生物組的組成和多樣性。這項(xiàng)研究為微生物在疾病控制中的作用以及潛在治療靶點(diǎn)的探索提供了新的視角。